Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CXCL2P19875 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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