Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB9P17482 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms