Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L5P0DN76 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms