Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGA3P0DJD8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms