Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C4BP0C0L5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
C4BP0C0L5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
C4BP0C0L5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
C4BP0C0L5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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