Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEBLO76041 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NEBLO76041 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEBLO76041 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEBLO76041 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEBLO76041 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEBLO76041 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEBLO76041 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEBLO76041 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms