Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMC8O43402 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMC8O43402 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMC8O43402 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EMC8O43402 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMC8O43402 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMC8O43402 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMC8O43402 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMC8O43402 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMC8O43402 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMC8O43402 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMC8O43402 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMC8O43402 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMC8O43402 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMC8O43402 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMC8O43402 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMC8O43402 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMC8O43402 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMC8O43402 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms