Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACOD1A6NK06 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms