Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms