Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCN11AQ9UI33 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SCN11AQ9UI33 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms