Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT172Q9UG01 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms