Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL9Q9P2J3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms