Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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