Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRRCC1Q9C099 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms