Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PACSIN1Q9BY11 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms