Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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