Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2AFJQ9BTM1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms