Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR4

ZDHHC12, Probable palmitoyltransferase ZDHHC12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC12Q96GR4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZDHHC12Q96GR4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms