Protein–RNA interactions for Protein: Q92754

TFAP2C, Transcription factor AP-2 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2CQ92754 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFAP2CQ92754 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms