Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BEST4Q8NFU0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms