Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG16L1Q676U5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG16L1Q676U5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms