Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OTUD1Q5VV17 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms