Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RNF220Q5VTB9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms