Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHYHD1Q5SRE7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PHYHD1Q5SRE7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms