Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL38Q2WGJ6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms