Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Q1T7F1 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Q1T7F1 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms