Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDO1Q16878 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDO1Q16878 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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