Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SP140Q13342 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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SP140Q13342 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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SP140Q13342 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SP140Q13342 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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SP140Q13342 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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SP140Q13342 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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SP140Q13342 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP140Q13342 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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SP140Q13342 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP140Q13342 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP140Q13342 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP140Q13342 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP140Q13342 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP140Q13342 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SP140Q13342 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SP140Q13342 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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