Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME3Q13232 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NME3Q13232 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NME3Q13232 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NME3Q13232 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME3Q13232 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME3Q13232 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
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