Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
OCA2Q04671 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
OCA2Q04671 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.6 ms