Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPCQ01831 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPCQ01831 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPCQ01831 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPCQ01831 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPCQ01831 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPCQ01831 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPCQ01831 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPCQ01831 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPCQ01831 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPCQ01831 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPCQ01831 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPCQ01831 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPCQ01831 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPCQ01831 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPCQ01831 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPCQ01831 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPCQ01831 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPCQ01831 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
XPCQ01831 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
XPCQ01831 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
XPCQ01831 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
XPCQ01831 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
XPCQ01831 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
XPCQ01831 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms