Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MDM2Q00987 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MDM2Q00987 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms