Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A3P48751 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms