Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAPGP40121 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAPGP40121 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CAPGP40121 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms