Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RGPD1P0DJD0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms