Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLK3P07288 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KLK3P07288 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLK3P07288 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms