Protein–RNA interactions for Protein: P01876

IGHA1, Immunoglobulin heavy constant alpha 1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHA1P01876 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHA1P01876 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms