Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKAP2O75563 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms