Protein–RNA interactions for Protein: O15066

KIF3B, Kinesin-like protein KIF3B, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3BO15066 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF3BO15066 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF3BO15066 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms