Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms