Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms