Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
MRPS28Q9Y2Q9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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