Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POMPQ9Y244 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms