Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms