Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms