Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GPHNQ9NQX3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms