Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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FOXQ1Q9C009 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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FOXQ1Q9C009 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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FOXQ1Q9C009 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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FOXQ1Q9C009 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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FOXQ1Q9C009 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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FOXQ1Q9C009 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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FOXQ1Q9C009 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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FOXQ1Q9C009 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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FOXQ1Q9C009 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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FOXQ1Q9C009 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FOXQ1Q9C009 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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