Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SH3GL2Q99962 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms