Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE2Q96MF7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms