Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C10orf53Q8N6V4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C10orf53Q8N6V4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms